Cov qhab nia sib npaug li cas?
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Video: Cov qhab nia sib npaug li cas?

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Anonim

Cov qhab nias ntawm ib kev sib tw , S, xam raws li tus lej ntawm kev hloov pauv thiab qhov sib txawv cov qhab nias . Hloov pauv cov qhab nias yog muab los ntawm ib lub rooj saib (saib PAM, BLOSUM). Gap cov qhab nias feem ntau yog xam Raws li qhov suav ntawm G, qhov sib txawv qhib qhov nplua thiab L, qhov sib txawv ncua kev nplua. Rau qhov sib txawv ntawm qhov ntev n, tus nqi sib txawv yuav yog G + Ln.

Raws li, qhov qhab nia sib npaug yog dab tsi?

Qhov zoo kev sib tw thiab alignment qhab nia Qhov zoo kev sib tw yog ib kev sib tw muab qhov siab tshaj plaws qhab nias , thiab alignment qhab nia yog qhov siab tshaj no qhab nias . Ntawd yog, lub alignment qhab nia ntawm X thiab Y = cov qhab nias ntawm X thiab Y nyob rau hauv qhov kev pom zoo kev sib tw . Piv txwv li, lub alignment qhab nia ntawm X thiab Y yog 36.

Ib sab saum toj no, kev sib txuas ua ke ua haujlwm li cas? Hauv bioinformatics, a kev sib raug zoo yog ib txoj hauv kev npaj cov ua ntu zus DNA, RNA, los yog protein los txheeb xyuas thaj tsam ntawm qhov zoo sib xws uas tej zaum yuav yog qhov tshwm sim ntawm kev ua haujlwm, kev tsim, lossis kev sib raug zoo ntawm cov ua ntu zus.

Ntawm no, qhov qhab nia hauv bioinformatics yog dab tsi?

Hauv cov ntsiab lus ntawm kev sib txuas ua ke, a qhab nias yog tus lej lej uas piav qhia txog qhov zoo ntawm qhov kev sib tw. Cov lej siab dua sib npaug sib npaug. Cov qhab nias scale nyob ntawm qhov qhab nias system siv (hloov matrix, gap nplua).

Dab tsi yog qhov zoo tshaj plaws alignment nyob rau hauv ib theem zuj zus?

Cov kev sib haum xeeb zoo ntawm ob protein ua ntu zus yog cov kev sib tw uas ua kom cov lej ntawm khub-cov qhab nia tsawg dua qhov kev nplua rau kev nthuav qhia qhov sib txawv. Dynamic programming tso cai rau cov kev sib haum xeeb zoo ntawm ob ua ntu zus kom pom nyob rau hauv qhov kev txiav txim ntawm mnsteps, qhov twg m thiab n yog qhov ntev ntawm qhov ua ntu zus.

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